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細胞色素P450酶系體外藥物代謝研究方法進展

更新時間:2020-07-07      點擊次數:5727

細胞色素P450酶系體外藥物代謝研究方法進展

來源:中國藥事2013年第27卷第1期

作者:于敏,張雙慶,聞鎳,李佐剛

中國食品藥品檢定研究院食品藥品安全評價研究所

 

摘要

目的:綜述細胞色素P450(CYP450)酶影響藥物代謝的體外研究方法。

方法:參考國內外文獻,對與藥物代謝相關的CYP酶亞型、CYP酶種屬差異、CYP酶體外反應體系、藥物主要代謝酶的確認方法及體外CYP酶的抑制和誘導,進行分類、歸納和整理。

結果與結論:CYP450在藥物代謝中具有重要作用,藥物代謝研究是新藥評價體系中重要的一部分。

 

關鍵詞

細胞色素P450酶;藥物代謝;藥物相互作用;體外研究

 

藥物進入機體后主要以兩種方式被清除:一種是藥物不經任何代謝而直接以原型形式排出體外;另一種是部分藥物在體內經代謝后,再以原型和代謝物的形式排出體外。當藥物主要通過代謝被清除時,代謝途徑可顯著影響藥物的安全性、療效及用法。

藥物的代謝,也稱為生物轉化,在體內主要有兩個步驟:第1步稱為Ⅰ相代謝反應,藥物在這相反應中被氧化、還原或水解;催化Ⅰ相反應的酶主要為肝微粒體中的細胞色素P450酶(CytochromeP450,CYP450)。

第二步稱為Ⅱ相代謝反應,藥物在這一相反應中與一些內源性的物質(如葡萄糖醛酸、甘氨酸、硫酸等)結合或經甲基化、乙酰化后排出體外;催化Ⅱ相反應的酶有許多,其中主要的有葡萄糖醛酸轉移酶、谷胱甘肽-S-轉移酶、磺基轉移酶和乙酰基轉移酶等。

在上述的代謝反應中,由P450酶所催化的Ⅰ相反應是藥物在體內代謝轉化的關鍵性步驟,因為這一步反應常常是藥物從體內被清除的限速步驟,它可以影響到藥物許多重要的藥動學特性,如藥物的半衰期、清除率和生物利用度等[1];此外,若藥物通過單個代謝途徑被清除,則代謝速率的個體差異可導致血液和組織中的藥物和代謝產物濃度出現巨大差異。

 

1細胞色素P450酶

細胞色素P450酶,是一種以鐵卟啉為輔基的蛋白質,不僅分布于肝臟,小腸和腎臟也有表達,由血紅素蛋白(P450)、黃素蛋白(NADPH-細胞色素C還原酶)及磷脂三部分組成,相對分子質量為45000~55000Da。P450酶系由Klingberg和Gorfinkle在1958年發現的,由于它在還原狀態下可以與CO結合,并在波長為450nm 時有大吸收峰,因此而得名[2]。該酶有許多同工酶,故稱細胞色素P450酶系,簡稱為CYP450S。CYP450S的命名方法:第1個數字表示族,第二個英文字母表示亞族,第三個數字表示某種特定的酶, 如CYP2D6[3]。

CYP450S的分類:CYP450S是一組由許多同工酶組成的超基因大家庭,隨著分子生物技術的發展和人類基因組計劃的完成,人類編碼CYP450S的基因已基本明確,由18個基因家族,43個亞家族,57個基因,59個假基因組成。

在人類肝臟各種代謝酶中,CYP3A4、CYP2C、CYP1A2和CYP2E1分別占29%,17%,12% 和6%,CYP2A6 占4%,CYP2D6占1%[4]。雖然有18個基因家族,但是大約95%的藥物氧化作用由6種CYP酶催化執行,其中CYP3A4占35%,CYP2D6占15%,CYP1A2占12%,CYP2C9占9%,CYP2C19占8%,CYP2B6和CYP2E1均占6%,CYP2A6占3%[5]。

 

該酶系具有以下幾方面的生物學特性:

(1)P450酶是一個多功能的酶系,可以催化60種以上的代謝反應,它可作為單加氧酶、脫氫酶、還原酶、過氧化酶、酯酶等而催化代謝反應,因此P450酶可以催化一種底物同時產生幾種不同的代謝物;

(2)P450酶對底物結構的特異性不強,可代謝各種類型化學結構的底物,每一種P450酶都有廣泛的底物,既能代謝大分子底物,也能代謝小分子的底物;

(3)P450酶存在有明顯的種屬、性別和年齡差異。

其中以種屬差異表現-為明顯,不同種屬的P450同工酶組成不同,因此藥物在不同種屬動物和人體內的代謝途徑及代謝產物可能不同。這是由于P450在不同種屬中基因表達上的差異所造成的,P450酶在不同種屬的動物和人體內的表達有質和量的差異,因此不同種屬動物和人體內的P450酶底物和產物特異性及P450酶活性可以不同。這是造成代謝種屬差異的主要原因,因此我們不能*用動物P450酶來代替人的P450酶進行研究,具體的CYP酶亞型見表1。

 

P450酶的性別差異在大鼠體內表現-為明顯,現已發現雌雄大鼠體內P450同工酶的組成有明顯的質和量的差異,某些藥物在雌、雄大鼠體內的主要代謝途徑和代謝產物可能是不同的,因而造成其在雌雄大鼠體內的毒性也存在明顯的差異,這值得引起臨床前藥動學和毒理學研究的重視。

P450酶在年齡上的差異主要表現在酶量和活性方面[6];

(4)P450酶具有多型性,它是一個*家族,每種哺乳動物至少有30種以上的P450酶,由此可見P450酶系是由多種類型的P450酶所組成的一個龐大家族;

(5)P450 酶具有多態性(PolymorPhism),即同一種屬的不同個體間某些P450酶的活性存在較大差異,可將個體按代謝速度的快慢分為四種表型:弱代謝型(PMs)是缺乏功能酶,中等代謝型(IMs)是等位基因缺失雜合子,強代謝型(EMs)是攜帶兩個功能基因拷貝,和*代謝型(UMs)是攜帶兩個以上功能基因拷貝。

現已發現在人肝P450 酶中,CYP1A1-3、CYP2C8-9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1和CYP3A3-4均表現出明顯的多態性,其中以CYP2D6和CYP2C19的多態性-為典型,如由CYP2C19參與的S-美芬妥因的羥化代謝就表現出典型的多態性,即不同個體對S-美芬妥因的羥化代謝速度存在非常顯著的差異,按代謝速度可以將人群分為兩種類型,即PMs 和EMs,前者的血藥濃度明顯高于后者,PMs的AUC值(藥-時曲線下面積)顯著升高,消除半衰期明顯延長。

P450酶的多態性主要是由于其基因缺陷所致,這種基因缺陷可能是由于遺傳變異所造成的。

P450酶的多態性不僅表現在同一種屬的不同個體間,同時不同種族間的代謝缺陷發生率也存在顯著差異,如CYP2D6在不同種族中的PMs的發生率就存在明顯的種族差異,黃種人對異喹胍的代謝缺陷(即PMs)發生率為1%左右,黑人的代謝缺陷發生率為0%~2%,而白種人的代謝缺陷發生率高達5%~10%[7]。

(6)P450酶具有可誘導性和可抑制性。

一方面包括藥物在內的很多化學異物可對P450酶產生誘導作用,使某些P450酶的量和活性明顯增加。

人們較早發現了這一現象,其中典型的例子就是苯-巴比妥可以誘導肝P450酶,從而加速其自身的代謝,使其鎮靜、催眠作用減弱。

另一方面,許多外源性的化學異物包括許多藥物可以選擇性地抑制某些P450酶,使其活性明顯降低,因而可以抑制其對其他化學異物的代謝[8]。

 

2細胞色素P450酶系藥物代謝研究方法

2.1 所需材料和儀器

受試藥物,混合肝微粒體,磷酸鉀緩沖液(PH7.4,50~100mmol·L-1),NADPH再生系統(匯智泰康NADPH再生系統,包括Solution A和SolutionB兩種試劑,臨用混合,A試劑含有31mMNADP+、66mMG-6-P和66mMMgCl2,B試劑含有40U·mL-1G-6-PDH,其再生原理為G-6-PDH 催化G-6-P脫氫,并將NADP+轉化為NADPH,其中Mg2+ 是G-6-PDH 催化反應所必需的輔助因子)或者市售的NADPH 和MgCl2,LC-MS/MS,離心機,37°C水浴搖床,超低溫冰箱。

2.2 所需溶液的配制

反應緩沖液(50mmol· L-1PH7.4匯智泰-康磷酸鹽緩沖液),反應啟動液(Solution A和SolutionB臨用前4°C過夜解凍,置冰浴中,按5∶1 (v/v)混合,再加入反應緩沖液稀釋至NADP+含量約為1mmol·L-1后使用)/ (1mmol·L-1NADPH 溶液和5mmol·L-1MgCl2),反應終止液(冰冷的內標甲醇溶液,-20°C儲存,加入3倍體積終止反應),肝微粒體(匯-智泰康可提供猴肝微粒體,大鼠肝微粒體,小鼠肝微粒體等)溶液(-70°C取出后37°C水浴1min快速解凍,然后迅速轉移至冰浴中用反應緩沖液稀釋至0.2mg·mL-1,不可反復凍融),受試藥物儲備液及工作液,內標溶液。

2.3 建立反應體系

(1)NADPH溶液、微粒體溶液、受試藥物工作液和反應緩沖液放入37°C水浴中,50rPm下恒溫5min;(2)取不同摩爾濃度的受試藥物工作液150μL,加入0.2mg·mL-1的微粒體溶液60μL,不建議渦旋混勻,加入反應啟動液NADPH 再生系統90μL混勻后開始計時;(3)分別于孵育不同時間取出20μL孵育液,轉移到冰浴上,加入3倍體積反應終止液終止反應,渦旋,離心,取上清液10μLLC-MS/MS進樣分析[9];(4)根據實驗結果,優化孵育時間、底物濃度、微粒體蛋白濃度。

2.4 反應體系注意事項

2.4反應體系注意事項

(1)體外孵育條件:緩沖體系的選擇,緩沖體系的離子強度,孵育環境PH 值,孵育時間和微粒體蛋白濃度都會影響酶促反應的代謝速度。

底物濃度應當過量,大于酶適底物濃度約10倍,且反應消耗量應當<20%。

(2)有機溶劑的影響:由于許多P450酶底物和抑制劑都是強疏水性化合物,建立水性反應體系時,不可避免會用到甲醇、乙醇、乙腈和二甲基亞砜(DMSO)等有機溶劑。

但是,有機溶劑會影響天然酶反應環境和酶活性,從而改變酶-底物相互作用,因此,有機溶劑的濃度要求<1% (v/v),-好<0.1%。

(3)非特異性微粒體結合:因為大部分藥物都是脂溶性有機化合物,會與微粒體膜上的脂質蛋白產生非特異性結合,使得游離的底物濃度小于添加濃度。

會出現基于添加濃度的表觀Km值(米氏常數,即藥物在體內的消除速度為Vm的一半時所對應的血藥濃度)高于真實Km,但其不影響Vmax值,導致高估了Km值而低估了體內藥物清除率(CL)。

因此,應當優化微粒體蛋白濃度,選用可定量代謝物的低蛋白濃度,使非特異性蛋白結合小化。

2.5 數據分析

2.5.1 典型酶促動力學

典型的CYP介導的酶促反應動力學符合米氏方程(公式1)特征,擬合動力學曲線,計算酶促動力學參數Vmax和Km,其中v 是反應速度, [S]是底物濃度,Vmax是大反應速度,Km是米氏常數———表示達到大反應速度一半時的底物濃度。

從反應式1得出Km是反映速度的常數,Km= k-1+k2/k1。

有報道稱Km是反映底物對酶的親和性,此說法是不正確的[10]。

因v=CLint· [S],將米氏方程轉換得到公式2,通過Vmax和Km值可以計算得到藥物的體外固有清除率,將體外清除率(CLint)外推得到該藥物的體內CLint。

2.5.2 動力學曲線

通過擬合動力學曲線,可以快速求出參數值,而且可以初步判斷有無酶抑制現象或者是否是非典型酶促動力學。

2.5.2.1 Lineweaver-Burk 作圖

以1/v為y軸,1/ [S]為x軸作圖,得到一條直線,直線的斜率即Km/v,y軸截距是1/Vmax,x軸截距是-1/Km。

此作圖方法是用的計算酶促動力學參數的方法,但其會夸大底物濃度低時的錯誤,故常用于初期參數評價,而不常用于終參數確定。

2.5.2.2 Hanes-Woolf 作圖

以[S]/v為y軸,[S]為x軸作圖,得到一條直線,直線的斜率即1/Vmax,y軸截距是Km/Vmax,x軸截距是-Km。

與前種方法比較,此作圖方法錯誤概率小且恒定,是確定酶促動力學參數更好的選擇。

2.5.2.3 Eadie-Hofstee 作圖

以v為y軸,v/ [S]為x軸作圖,得到一條直線,直線的斜率即-Km,y軸截距是Vmax,x軸截距是Vmax/Km。

此作圖方法因x軸是速度,是一個變量,會引入更多的實驗誤差。值得關注的是,根據此作圖方法擬合曲線的形狀可以判斷非典型酶促動力學的類型。

2.5.3 非典型酶促動力學

大部分CYP酶介導的藥物代謝反應符合典型酶促動力學的雙曲線模型,但是一些P450酶會呈非典型酶促動力學,是由于酶和底物分子具有多個結合位點造成動力學行為的改變。

非典型酶促動力學有四種模型:反曲線同向協同(HomotroPicCooPerativity:SigmoidalKinetics),二段式同向協同(HomotroPicCooPerativity:BiPhasicKinetics),底物抑制動力學和異向協同(HeterotroPicCooPerativity)。

同向協同是兩個相同的底物分子協同作用的結果,異向協同是兩個結構上*不同的底物分子協同作用的結果。

2.5.4 酶抑制動力學

此效應是緣于抑制劑效應分子的存在,使得酶被抑制,底物反應速度下降。

通過體外酶抑制動力學可以預測可能存在的藥物-藥物相互作用。

其中對酶的抑制作用按機理分為可逆性,半可逆性和不可逆性三類。

不可逆性抑制是抑制劑(也可稱滅活劑Inactivator)和酶形成的結合物被酶激活后不可逆地使酶失去活性,其呈現時間依賴性,往往抑制劑從體內清除后其抑制作用還會存在一段時間。

可逆性抑制(ReversibleInhibitor)包括三種:競爭性抑制(ComPetitiveInhibition),非競爭性抑制(NoncomPetitiveInhibition) 和反競爭性抑制(UncomPetitiveInhibition)。

競爭性抑制是簡單見的類型,是抑制劑與底物競爭游離酶的結合部位,對反應的Vmax不產生影響,會增加Km值,可以用公式3來表示。

非競爭性抑制比較少見,是抑制劑與底物可逆性地結合,對Km不產生影響,會降低Vmax,通常認為混合抑制的初期表現為此抑制現象。

反競爭性抑制是抑制劑只與酶-底物復合物結合,而不與游離酶結合,使得Km和Vmax都變小,但Vmax/Km比值不變,可以用公式4來表示。

此外,還有混合抑制(MixedInhibition),表現為Vmax降低,Km增高,由于多種結合機制造成,抑制劑可與底物競爭游離酶的結合部位,抑制劑先結合酶分子再與底物結合,抑制劑還可結合酶-底物復合物。

IC50和Ki通常用來表示一個化合物的抑制能力,但兩者不等同。

Ki= [E][I]/ [EI],由多個底物濃度(通常3~4種)和多個抑制劑濃度(通常4~5種)確定;IC50是由一個底物濃度和多個抑制劑濃度確定。

IC50表示底物代謝被抑制50%時的抑制劑濃度,Ki是酶-抑制劑復合物的解離常數。

IC50與底物濃度以及酶濃度相關,Ki值與此類因素無關,故只有在相同底物濃度和相同酶濃度時IC50值才可以相互比較,而不同底物的Ki值可以相互比較。

此外,當底物濃度非常接近Km值時,IC50/2等于Ki。

3確定受試藥物的代謝途徑和主要代謝產物

代謝途徑鑒定實驗,是將藥物和不同種系(匯智泰康不同種系肝微粒體,大鼠肝微粒體,比格犬肝微粒體,小鼠人肝微粒體,人肝微粒體等)的混合肝微粒體一起孵育,或用肝細胞或者肝臟部分組織培養藥物,然后通過HPLC-MS/MS分析孵育介質或培養基和細胞內容物,可以大致確定該藥物是否是肝微粒體P450酶的底物,可以直接獲得氧化、水解或基團轉移形成的代謝物,提供平行代謝還是先后代謝的信息,以及主要代謝途徑和代謝產物可能存在的種屬差異。

 

此項分析需要借助代謝物譜預測篩查軟件進行。

4藥物代謝酶的確認并注意CYP酶的種屬差異

如果CYP酶對藥物的代謝量大于藥物總清除率的25%,則應當進行CYP酶鑒定研究,也稱為反應表型研究[11]。

利用下述3種方法確認不同的CYP酶對藥物代謝的貢獻。

4.1 計算機輔助設計對接預測

根據蛋白質數據庫(ProteinDataBank)提供的信息得到CYP450酶亞型的晶體結構。

藥物-CYP450蛋白空間模擬對接時,主要基于空間位置上鄰近CYP450蛋白中血紅素和鐵氧離子的底物識別位點而進行。

運用軟件的對接程序,通過漸進式構造算法來計算優化配基與底物識別位點間的相互作用,通過氫鍵和疏水作用的加合來計算自由能,進而利用軟件的評分功能將計算所得的自由能數值求和后按照從小到大的順序排序。

4.2 特定的化學物質或抗體作為特異性酶抑制劑

大部分化學抑制劑對各個CYP酶均無特異性,表2列出了實驗可選用的特異性化學抑制劑[12]。

藥物的濃度要≤ Km值,盡可能在初始比率條件下(代謝產物產生速率與時間和酶濃度呈線性)進行實驗。

抑制劑均用甲醇溶解,采用一系列濃度。

當使用基于作用機制的抑制劑(Mechanism-BasedInhibitor)時,將抑制劑與酶預先孵育15~30min。同時,還應注意同一抑制劑對不同種屬同一CYP酶的靈敏度不同。

選擇足夠低和足夠高的抗體濃度來對抑制抗體的抑制作用進行試驗,以確定滴度曲線。

4.3 應用不同的重組CYP酶

這種技術對研究單個CYP酶在整個藥物代謝中的相對貢獻的大小具有很高的價值,但不能代表人肝微粒體在體外的代謝比率。

重組酶孵育體系與肝微粒體相似,除CYP2A6和CYP2C9的反應介質為Tris緩沖液(PH7.5)外,其他酶的介質均為磷酸鉀緩沖液(PH7.4)。

5確定受試藥物是否是肝微粒體P450酶的抑制劑

5.1 實驗設計注意事項

(1)將藥物與合適的探針底物[12] (見表3)和相應的CYP450酶共培養。

(2)測定IC50時,在底物代謝率允許的情況下,盡量使底物濃度低于Km值,使IC50與Ki值更具相關性。

(3)肝微粒體蛋白濃度通常<1mg·mL-1。

(4)緩沖液的性質、PH 對Vmax和Km會有影響,盡可能采用標準化分析條件。

(5)反應系統中控制底物或抑制劑的消耗不超過10%~30%,但是對于Km值很低的藥物來說,控制反應體系底物消耗<10%很困難。

(6)建議時間-產物形成量呈線性關系。

(7)建議酶量-產物形成量呈線性關系。

(8)所有溶劑的濃度都要<1% (v/v),-好<0.1%,同時設立無溶劑對照。

(9)實驗設立一個已知抑制劑的陽性對照(見“4.2”項下)。

(10)結果分析,確定受試藥物是否是可逆性抑制劑,是否是基于作用機制抑制劑[11]。

5.2 確定受試藥物是否是可逆性抑制劑

理論上,抑制劑在作用部位的濃度與底物的Ki值相當或超過Ki時會產生明顯的抑制效應。相互作用程度(以R表示,代表底物AUC改變的倍數)可以通過R=1+ [I]/Ki進行評估,[I]是酶活性部位暴露的抑制劑濃度,代表了給予-高推薦臨床劑量后,所有藥物(結合和未結合)的平均穩態Cmax值;Ki是抑制常數。

目前推薦根據[I]/Ki可以預測體內相互作用的可能性,比值升高,產生相互作用的可能性增大[13],見表4。

盡管通過體外數據定量預測體內相互作用發生的可能性存在困難,但可以通過同一個藥物對不同CYP 酶(CYP1A2, CYP2C8, CYP2C9,CYP2C19,CYP2D6和CYP3A)的[I]/Ki值進行篩選排序。

采用大[I]/Ki比值的CYP開展體內研究,如果該CYP顯示無體內相互作用,則無需進行其他CYP體內評價研究。

對于CYP3A的抑制劑,建議評價2個結構不相關的底物,如果其中一個顯示有潛在相互作用,則應進行體內評價。

5.3 確定受試藥物是否是基于作用機制抑制劑

體外實驗還應進行時間依賴抑制篩查,建議加入底物前,對潛在抑制劑進行30min預培養,起始產物形成率的所有時間依賴性及濃度依賴性損失均表明為作用機制性抑制[14]。

6

確定受試藥物是否是肝微粒體P450酶的誘導劑

6.1 實驗設計注意事項

(1)受試藥物的濃度應該參考臨床治療劑量的血藥濃度,至少包括3個涵蓋治療窗的篩選濃度,其中至少1個濃度要超過平均預測血藥濃度1個數量級。

(2)與完整的單層肝細胞或分離的微粒體共孵育2~3d后,通過CYP特異的探針底物(見表3),參照“5.1”項實驗條件測定酶活性。

(3)應包括一個*的酶誘導劑[12] (見表5)作為陽性對照,來減小不同供體酶催化活性差異引起的誤差。

6.2 酶誘導終點預測

受試藥物體外實驗引起的酶活性的改變≥40%陽性對照結果時,可以認為藥物具有酶誘導作用,需要進一步的體內研究。

根據目前了解的CYP酶誘導的細胞學機制,如果一個誘導實驗顯示CYP3A4酶沒有誘導作用,可以推斷此藥物對CYP2C8,CYP2C9和CYP2C19也沒有誘導作用[15]。

6.3 其他方法

除直接測定酶活性方法外,還有一些其他的方法確定誘導性。應用特異性的多克隆抗體進行WesternBlotting對酶進行定量,該方法需要解決電泳技術對不同CYP酶的*分離問題和抗體對CYP酶的特異性問題。應用RT-PCR 技術測定細胞內特定酶的mRNA表達水平,但有時mRNA的表達水平與酶活性的關系不能確定, 但是當酶誘導作用(mRNA水平上調)和酶抑制作用(酶活性下調)同時存在時,mRNA的測定是有益的。對于受體介導的CYP酶誘導作用可以采用受體基因測定的方法,細胞表面受體介導的CYP1A,CYP2B和CYP3A 酶誘導作用已經被確認,已經開發了高通量AhG (芳烴受體)和PXR (孕甾烷X受體)結合測定和細胞受體基因測定法,并用于篩選具有CYP1A和CYP3A誘導可能性的化合物。

參考文獻

文章來源:中國藥事2013年第27卷第1期

 

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體外藥物代謝產品
Ⅰ相代謝穩定性試劑盒
Ⅱ相代謝穩定性試劑盒
CYP450酶代謝表型研究試劑盒
不同種屬肝微粒體,肝S9
CYP450酶,標準品,孵育系統等

遺傳毒性產品
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TK基因突變試驗試劑盒
HPGRT基因突變試劑盒
彗星試驗試劑盒
誘導大鼠肝S9等

空白生物基質
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空白血漿:食蟹猴,恒河猴,比格犬,大鼠,小鼠,豬,兔
空白血:食蟹猴,恒河猴,比格犬,大鼠,小鼠,豬,兔
空白尿液:食蟹猴,恒河猴,比格犬,大鼠,小鼠

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